TUNEL染色（TdT-mediated dUTP Nick-End Labeling）是一種用於檢測細胞凋亡的原位染色方法。其原理如下：
在細胞凋亡過程中，染色體DNA會發生斷裂，形成大量的3′-OH末端。這些3′-OH末端可以在末端脫氧核苷酸轉移酶（TdT）的催化下，加上標記了螢光素（如FITC）的dUTP（fluorescein-dUTP）。這樣，凋亡細胞可以通過螢光顯微鏡或流式細胞儀進行檢測。
TdT還可以將脫氧核糖核苷酸和過氧化物酶、鹼性磷酸化酶或生物素形成的衍生物標記到DNA的3′-末端，從而進行凋亡細胞的檢測。
由於正常的或正在增殖的細胞幾乎沒有DNA的斷裂，因此很少被染色。這種方法對研究細胞凋亡的機制和過程非常重要。