"三合一制度"有兩種含義，具體如下：
企業登記制度：
指的是營業執照、組織機構代碼證與稅務登記證「一表登記、三證合一」的制度。
市場主體通過一次性提交所需的所有信息，相關部門受理申請並進行審核，準予登記後發放一份包含營業執照、組織機構代碼證、稅務登記證功能的證照。
檔案管理制度：
是一種規範和指導檔案形成與收集、整理與歸檔、鑑定與銷毀等工作的基本檔案制度。
該制度包括機關檔案分類方案、檔案材料歸檔範圍和檔案保管期限等內容。
全面推行三合一制度對於提升機關檔案基礎業務和信息化水平，建設更加廣泛、豐富、最佳化的檔案資源體系，維護國家檔案資源完整與安全，促進檔案事業健康長遠發展具有重要意義。
以上兩種含義均體現了「三合一制度」在不同領域的套用和重要性。