三系法是一 種 雜交育 種方法，主要 用於 雜交水稻的育 種 過程中。它 包括 三個基本的 遺 傳系：不育系、保持系和 恢復系。
不育系： 這 種系是雄性不育的，即花粉退化但雌蕊正常，不能自花授粉 結 實。它需要依靠外 來花粉才能受精 結 實， 用於生 產 雜交 種子。
保持系： 這是一 種正常的水稻品 種，其特殊功能是用它的花粉授 給不育系 後，所 產生 後代仍然是雄性不育的。 藉助保持系，不育系就能一代一代地繁殖下去。
恢復系： 這也是一 種正常的水稻品 種，其特殊功能是用它的花粉授 給不育系所 產生的 雜交 種雄性 恢復正常，能自交 結 實。如果 該 雜交 種有 優 勢的 話，就可 用於生 產。
三系法的主要原理是首先把 雜交母本 轉育成不育系，例如，希望 雜交 組合(甲×乙)利用已有的雄性不育性 進行制 種， 則 必須先把母本 轉育成甲不育系。原 來雄性正常的甲 稱 為即成 為甲不育系的同型保持系，它除了具有雄性可育的性 狀以外，其它性 狀均 與甲不育系相同，故又 稱同型系，它能 為不育系提供花粉，保 證不育系的繁殖留 種。父本乙 必須是 恢復系。如果乙原 來就 帶有 恢復基因， 經 過 測定，就可以直接利用配置 雜交 種，供大田生 產用。
通 過 這 種方式，三系法 為 雜交水稻的育 種提供了可能性，使得不育系能 夠生 產大量 雜交 種子，同 時保持系的繁殖能力，以及 恢復系的 雜交 種雄性 恢復能力，共同 構成了三系法的核心。