祖源分析是一種利用個體繼承的基因組信息來追溯祖先背景的科學方法。它涉及分析個體從祖先那裡繼承的DNA突變，這些突變在族群的演化過程中積累，從而揭示祖先的起源、遷移和貢獻。祖源分析可以揭示個體中不同地區祖先的血統比例，例如歐洲血統的比例，以及個體是否具有特定的歷史後代背景，如三皇五帝的後代或夏朝、商朝、周朝的後代。
祖源分析的原理基於從父母那裡繼承的DNA，這些DNA包含了多代人的遺傳信息。在演化過程中，這些信息通過DNA突變的形式傳遞下去，形成了不同的基因多態性。科學家通過分析這些基因突變的存在和出現的時間，以及它們在特定人群中的分布，來推斷個體的祖源信息。
例如，WeGene祖源成分分析就是基於常染色體上的單核苷酸多態性（SNPs）進行計算的，這種方法具有很強的群體特點，能夠較好地反映群體特徵。WeGene覆蓋了與東亞人群相關的42個族群，包括12支中華民族族群和其他30支在中國周邊或世界範圍內具有代表性的族群，從而幫助揭示個體的祖先背景。