連續發酵是一種發酵工藝，它通過向發酵罐內以一定的速度添加新鮮培養基，並同時以相同速度流出培養液，以維持發酵罐內液量的恆定。
這種方式可以保持發酵過程中pH值、養分、溶解氧等條件的穩定，從而使得微生物的生長和代謝活動保持旺盛和穩定狀態。連續發酵的優點包括設備體積減小、操作時間短、便於自動化控制、產物穩定、節省人力物力、生產費用低；其缺點是設備要求高、營養成分利用效率較低、產物濃度不如分批發酵高、雜菌污染機會較多、菌種可能因變異而退化。連續發酵系統通常包括培養室、無菌培養基容器以及可自動調節培養基流速的控制系統，必要時可裝有通氣和攪拌設備。
連續發酵可以分爲單罐連續發酵和多罐串聯連續發酵等方式。