最好的菩提子取決於具體的種類和產地。以下是一些被認為質量上乘的菩提子：
星月菩提：產自海南毛感的星月菩提品質最佳，因為其密度好，在盤玩過程中容易形成包漿，且抖動時能聽到清脆的撞擊聲。
金剛菩提：小金剛菩提因其小巧精緻、紋路多變、上色快等特點，近些年更受追捧。
鳳眼菩提：主要產於尼泊爾，其中熱振寺附近的百香籽（柏香籽）因密度大、油性足、皮質好而最出名。
紫金鼠菩提子：紫金鼠手串不怕油不怕汗，盤玩容易，變色快。
菩提根：雖然產量大，價位不高，但認真盤玩也能盤的又亮又潤。
元寶籽星月菩提：被認為是最適合做珠子把玩的菩提子之一。
在選擇菩提子時，除了種類和產地，個人的喜好和盤玩習慣也是重要的考慮因素。