住院醫師的職責主要包括：
在科主任的領導和主治醫師的指導下，負責一定數量的病人的醫療工作，包括新畢業的醫師實行三年12小時留院制，擔任住院、門診、急診的值班工作。
對病人進行檢查、診斷、治療，並書寫醫囑，還要檢查醫囑的執行情況。
書寫病歷，包括新入院病人的病歷，通常應在病人入院後24小時內完成，還要檢查和修改實習醫師的病歷記錄，並負責病人住院期間的病程記錄，及時完成出院病人的病案小結。
向主治醫師及時報告診斷、治療上的困難以及病人的病情變化，提出需要轉科或出院的意見。
對所負責的病人全面負責，下班前做好交班工作，對需要特殊觀察的重症病人，通過口頭或書面方式向值班醫師交班。
參加科內的查房，對所負責的病人每天至少上下午各巡診一次，上級醫師查房時應詳細彙報病人的病情和診療意見。
認真執行各項規章制度和技術操作常規，親自操作或指導護士進行各種重要的檢查和治療，嚴防差錯事故。
瞭解病人的思想和生活情況，徵求病人對醫療護理工作的意見，做好病人的思想工作。
積極參與科研工作，總結經驗，不斷學習和應用先進的醫學技術。