倪姓的起源較為複雜，涉及多個來源和歷史變遷，主要源於以下幾個方面：
出自郳\姓。在殷商之前，黃帝後裔建立了邾婁部落。周武王滅商後，邾婁被封為諸侯國，稱為邾。周公旦攝政時期，為了削弱諸侯國的勢力，封邾國夷父顏的次子友於郳地，建立郳\國（又稱小邾國）。「郳」、「倪」為同源字，「郳\」去「邑」為姓氏「倪」，這是倪姓的來源之一。
出自曹姓。春秋時期，邾武公的次子被封於郳\（故城在今山東滕州境內），建立郳國，其後代以國名為姓，稱為郳\氏。戰國時期，郳國被楚國所滅，為了避仇，改姓為兒（念ní），再後又以郳\去「阝」加「亻」旁成倪姓。漢初的御史倪寬，其先祖即為公子肥後裔。
出自春秋時邾國後人郳\黎來之後。避仇改為倪姓。
出自他族改姓或少數民族。後魏代北複姓賀郳\氏改郳姓後又改為倪姓；清滿洲八旗人有倪姓，世居寧古塔；滿、蒙古、土家等民族均有倪姓。
出自商諸侯兒伯。商諸侯有兒伯，子孫為倪姓。
綜上所述，倪姓是一個具有多元起源的姓氏，其歷史悠久，涉及多個來源和歷史變遷。