公司需要申報的稅種主要包括：
增值稅：所有企業都需要申報增值稅。一般納稅人可以抵扣進項，稅率有6%、9%、13%等，具體稅率取決於業務類型。小規模納稅人不可進項抵扣，稅率爲3%。小規模納稅人在滿足一定條件下可免徵增值稅。
附加稅：以實際繳納的消費稅、增值稅稅額爲基礎計算，包括城建稅、教育附加、地方教育附加等。小規模納稅人在季度銷售額不超過30萬時，可以免繳附加稅。
企業所得稅：根據企業所得額計算，稅率分爲25%、20%、15%等檔次。高新技術企業和研發費用可享受稅收優惠。小型微利企業在所得額100-300萬之間，按所得額50%計算所得稅，實際稅率10%。
印花稅：境內書立、領受規定的經濟憑證需繳納印花稅，如銷售合同、技術合同等，稅率通常爲萬分之三。
個人所得稅：爲員工發放工資時，需代扣代繳個人所得稅。自2019年起，實行綜合所得徵收，包括工資薪金、勞務報酬所得等，實行七級累進稅率。
以上稅種中，增值稅、企業所得稅、個人所得稅和印花稅是公司運營過程中常見的稅種，附加稅則根據實際情況繳納。