冬瓜的保存方法有多種，具體取決於是否切開以及保存時間的長短。
如果冬瓜未切開，最佳的方法是地窖儲存。選擇地勢高、排水良好的地塊，挖一個深約1米的地窖，將冬瓜放入，然後覆蓋一層稻草或麥稈進行保暖，這樣可以使冬瓜保持新鮮數月。另外，也可以使用沙藏法。在通風、陰涼的室內地面上鋪一層細沙，然後放置冬瓜，之間留有空隙以避免擠壓，再用細沙覆蓋，這種方法同樣可以保持冬瓜的新鮮度，但需注意通風和避免潮濕。
對於切開的冬瓜，正確的保存方法可以延長其保存時間。首先，使用乾淨的紙巾或抹布擦乾切口處的汁液，以避免細菌滋生。然後，可以在切口處塗抹一層薄薄的白酒，因為白酒具有殺菌消毒的作用，能有效延長冬瓜的保質期。接下來，使用保鮮膜緊密包裹切口，以隔絕空氣和外部細菌。
如果計劃在短時間內（幾天到一周）保存切開的冬瓜，可以將其放置在陰涼通風的地方，如廚房的角落或冰櫃的冷藏室。若需長期保存（半個月以上），則可以考慮將塗抹白酒並包裹好的冬瓜放入冰櫃冷凍室。
無論哪種保存方法，確保冬瓜存放在乾燥、通風良好且避光的地方至關重要，以延長其保鮮期。