南京的特色植物包括：
蓬虆：滿山都是，帶一點清香，蜜蜂特別愛光顧這種花。
延胡索：目前在紫金山看到紫色和黃色兩種，數量也很多。
天葵(夏無蹤)：葉片背面一般是紫色的，很奇妙的植物。
月腺大戟：老山和紫金山都很多，外表像一個一個眼睛。
豬秧草：又叫拉拉菜，是一種野菜，掐嫩尖可吃，味道一般般。
澤漆：又叫蛤蟆草，掐斷會有白色汁液，有毒勿碰。
石蒜：一叢叢很像蝴蝶蘭，秋天開黃花很壯觀。
雲台南星：一般在石頭縫比較多，名字很好聽，長相看起來蠻高貴的。
梓木草：又叫地仙桃，第一遍發的時候和婆婆納混淆了。
此外，南京還有著名的楓葉觀賞地點，如棲霞山、中山植物園紅楓崗、明孝陵石象路和牛首山。楓葉一般在10月下旬開始逐漸變紅，11月中旬將進入最佳觀賞期。
還有被稱為「活恐龍」的水杉，最早起源於一億多年前的中生代白堊紀，新生代第四紀冰期之後，水杉幾乎全部絕滅，只有中國少數區域，水杉在災難中得以存活。可觀賞的「水杉」分為:水杉、池杉、落羽杉，不同品種的水杉，顏色也有區別，水杉落葉前是純正的紅，落羽杉為紅褐色，池杉是橙紅色。欣賞地點包括明孝陵燕雀湖、南京中山植物園、玄武湖和池杉湖國家濕地公園。欣賞時間:11月底,12月初的初冬,日落前拍攝為最佳時間。