南瓜肉包子的做法主要包括以下步驟：
南瓜去皮切片後蒸熟，可以選用微波爐加熱五分鐘。
蒸熟的南瓜搗成糊狀，然後放入麵粉中，同時將酵母用少量溫水化開後加入麵粉中。
用筷子攪拌成無乾粉狀態，然後用手揉成光滑的麵團，覆蓋保鮮膜放在溫暖處發酵，這個過程大約需要一個小時，發酵至原來的2倍到2.5倍。
利用發酵時間準備肉餡，豬肉剁碎後加入蔥薑末、鹽、老抽、生抽、料酒、花椒水等調料拌勻，然後加入澱粉和水分三次攪拌至肉餡上勁。
麵團發酵好後，揉勻並分成小劑子，每個劑子用手壓扁後用擀麵杖擀成中間厚四周薄的餅皮。
餅皮中央放入適量的肉餡，然後拇指不動，食指往拇指這邊帶餅皮捏出褶子，直至收口。
包好的包子醒發20分鐘，然後冷水入鍋，包子之間留些空隙，大火燒開後蒸20分鐘。
蒸熟後關火，不要揭開鍋蓋，繼續燜3分鐘後再打開。
以上步驟完成後，美味的南瓜肉包子就製作完成了。