印花稅的會計分錄主要取決於印花稅的具體金額以及是否通過「應交稅費」科目進行核算。主要情況如下：
不通過「應交稅費」科目核算。適用於印花稅金額較小的情況，如定額貼花的營業賬簿和產權許可證照等。在實際購買時，直接減少銀行存款或庫存現金。會計分錄為：借方「管理費用（印花稅）」，貸方「銀行存款」或「庫存現金」。
通過「應交稅費」科目核算。適用於採購契約和銷售契約印花稅，這些稅費通常根據實際採購、銷售或購銷總額的一定百分比乘以稅率直接計算繳納。計提本月印花稅的會計分錄為：借方「管理費用」，貸方「應交稅費——應交印花稅」。實際交納印花稅的會計分錄為：借方「應交稅費——應交印花稅」，貸方「銀行存款」或「庫存現金」。
此外，還有情況涉及以前年度的印花稅處理。如果屬於以前年度的支出，則應計入「以前年度損益調整」。如果屬於當年度當期的計提，則應計入「營業稅金及附加」。