吻合器是一種在醫學手術中使用的設備，主要用於替代傳統的手工縫合技術。它的工作原理主要可以分為以下幾種：
鈦釘離斷或吻合原理。這種原理類似於訂書機，通過向組織內擊發植入兩排互相交錯的縫釘（通常是鈦釘或鉭釘）對組織進行雙排交叉釘縫，從而縫合組織並防止滲漏。這種釘合方法不會影響縫合部位及其遠端的血液供應，因為小血管可以從「B」形縫釘的空隙中通過。
熱熔技術和雷射焊接技術。這兩種技術通過在組織或器官的斷面上產生熱熔現象，然後將斷面緊密連線在一起，實現組織的修復或器官的吻合。雷射焊接技術尤其適用於精細的焊接，對周圍組織的損傷較小。
包皮環切吻合器的工作原理則是通過內環和外環的相互擠壓作用，阻斷局部的血液循環，使過長的包皮逐漸缺血、壞死，從而達到切割包皮的目的。
吻合器的使用相對於傳統手工縫合具有多種優勢，包括快速縫合、操作簡便、一次性使用避免交叉感染、縫合嚴密且保證血供，以及減少手術併發症等。