呼吸熵（Respiratory Quotient, RQ）是指單位時間內生物進行呼吸作用時釋放的二氧化碳量與吸收的氧氣量的比值。
呼吸熵是營養學和臨床醫學中的重要指標，用於評估生物體在產生能量時所使用的底物種類。在一般情況下，體內能量主要來源於碳水化合物和脂肪的氧化，而蛋白質的影響相對較小。呼吸熵的波動範圍通常在0.67到1.3之間，不同底物氧化時的呼吸熵不同，例如，脂肪氧化的呼吸熵約為0.70，蛋白質的呼吸熵約為0.8，而碳水化合物氧化的呼吸熵接近1.0。通過測量呼吸熵，可以了解細胞水平上不同底物的使用比例，從而評估營養狀態和代謝情況。