哌甲酯的合成方法如下：
將苯甲醯甲酸甲酯（2）與哌啶（3）反應，得到1-苯基-2-(1-哌啶基)-1,2-乙二酮（4）。
4與對甲苯磺醯肼（5）反應，得到4-甲基-N′-[1-苯基-2-(1-哌啶基)-2-氧代亞乙基]苯磺醯肼（6）。
6發生自由基重排反應，得到7-苯基-1-氮雜二環[4.2.0]-8-庚酮（7）。
7經醇解，得到消旋的α-(哌啶-2-基)苯乙酸甲酯（8）。
獲得8後，如按文獻方法，需Boc保護、水解成鹽，酸化得蘇-2-(N-叔丁氧羰基哌啶-2-基)苯乙酸（10）。
10經(S)-苯乙胺拆分得(2R,2′R)-2-(N-叔丁氧羰基哌啶-2-基)-苯乙酸·(S)-1-苯乙胺複合物（11）。
11經酯化後成鹽酸鹽，製得哌甲酯（1）。
這種方法步驟較短，原料廉價易得，產品收率高，手性純度好，生產成本低，原子經濟性好，適合於工業化生產。