城市一卡通的充值可以通過多種方式進行，具體如下：
使用支付寶充值。打開支付寶，搜尋城市一卡通，進入公交卡便捷充值小程式，將公交卡放在手機背面的NFC感應區進行感應識別，然後進行充值。
使用市政交通一卡通APP。在手機套用商店下載相應的APP，登錄後選擇充值選項，輸入充值金額並支付。
使用手機的錢包功能（適用於iOS系統）。在錢包套用中點擊市政交通一卡通卡片，選擇充值金額並使用綁定的銀行卡支付。
人工充值。前往一卡通服務網點進行充值，單次充值額需為10元整數倍。
移動充值和自助服務設備充值。使用具有NFC功能的智慧型手機下載「北京一卡通」App進行貼卡充值，或通過自助一體機、捷運自助售票機、銀行ATM等進行自助充值。
使用微信支付充值。將一卡通貼在具有NFC功能的安卓手機背面，通過微信完成充值。
網上服務平台充值。通過市政一卡通的網路服務平台，使用網銀給賬戶充值。