花甲的保存方法取決於其新鮮度以及計劃的使用方式。以下是根據不同情況整理的保存方法：
新鮮花甲的保存。直接放入水中加鹽浸泡，然後放入冰櫃保鮮層保存；使用保鮮袋或塑膠密封盒將花甲裝起來，確保儘量減少空氣接觸，然後放入冰櫃冷藏室，儘快在24小時內食用。
剛死亡的花甲。快速清洗後瀝乾水分，可以直接放入冷藏室或冷凍室保存。
煮熟的花甲。再次放入鍋中燒開，然後放入保鮮袋中，連同湯汁或調料一起放入冰櫃保存，建議在3天內食用完畢。
室溫下保存花甲。需要清洗乾淨後浸泡在鹽水中，加入幾滴香油或痲油可以提升保存效果，但保質期相對較短。
低溫保存法。將花甲放入冷藏或冷凍環境中，冷藏時保持水質清潔和容器密封，冷凍保存的花甲可以保存數周至數月。
鹽水保存法。鹽水具有殺菌作用，可以有效延長花甲的保存時間，浸泡花甲時確保所有花甲都被鹽水覆蓋，定期更換鹽水以保持清潔。
油水混合保存法。在容器中加入適量的清水和少許食用油，形成油膜阻隔空氣，將花甲洗淨後放入油水混合液中保存。
無論使用哪種保存方法，都要確保花甲在冷藏或冷凍狀態下保存，避免超過48小時。在食用之前，一定要仔細檢查花甲是否有變質跡象，如異味、腐爛等。