基流分割是流域水文分析計算和區域水資源評價中經常遇到的問題，目前對於基流分割存在許多方法。這些方法大致可分為圖解法、水文模型法、物理化學法、數學物理法及數值模擬法五類。
以下是幾種常見的基流分割方法：
圖解法。包括直線分割法，如水平線分割法和斜線分割法。水平線分割法假設洪水期間地下徑流消退與其補充相等，而斜線分割法則認為洪水期間地下徑流補充量大於地下徑流消退量。
水文模型法。利用水文循環模型，基於質量守恆原理計算各水均衡項。這種方法物理意義明確，具有客觀可重複性，但對使用者能力要求較高，且模型參數選取困難。
物理化學法。利用同位素放射性示蹤劑進行示蹤，結果準確，可信度高，但對監測儀器和監測區水文地質條件要求較高，費用昂貴。
數學物理法。通過建立數學物理方程來刻畫基流產流的物理機制，但當結果出現較大偏差時，多參數調整與適用範圍確定的難度較大。
數值模擬法。基於信號處理技術，包括滑動最小值法、濾波法和加里寧系列方法。這種方法精度高，客觀性強，操作簡便，計算速度快，可重複使用，且易於計算機自動實現。
在實際套用中，數值模擬法尤其是數字濾波法被廣泛套用和認可。例如，Eckhardt數字濾波法在美國65個流域的套用表明，該方法進行地下徑流分割最為合理。