保護吹哨人的措施可以從以下幾個方面進行：
限制信息知悉範圍。在接收、受理、轉辦吹哨人信息的過程中，應嚴格限定知悉人員範圍，避免信息不必要地擴散。
覈查過程保護。案件覈查應由受理人員牽頭，避免向覈查參與人員泄露吹哨人信息。實地覈查時，應保密吹哨人身份。
獎勵機制。建立適當的財務報批手續，以限制財務人員對吹哨人信息的知悉範圍，同時設立物質和精神獎勵，以激勵人們成爲吹哨人。
法律保障。政府應制定相關法律法規，保護吹哨人的人身權利，確保他們在舉報過程中不會受到打擊報復。
社會價值觀引導。倡導道義價值觀，維護社會公平正義，使更多人願意承擔起吹哨人的角色。
舉報渠道暢通。確保吹哨人能夠通過正當合法的途徑進行舉報，建立有效的傾訴對象。
制約與救濟。建立對惡意舉報和誣告陷害的制約機制，以及對吹哨人權利受損後的補救措施。
宣傳與評估。對舉報制度進行宣傳介紹，並對舉報的效果進行評估。
通過這些綜合措施，可以有效地保護吹哨人在履行其職責時的安全與權益。