孵蛋的過程主要包括以下幾個步驟：
入孵前的準備。準備孵化器，新購入的蛋需要靜置幾個小時至一天後再入孵，孵化器需要預熱，有利於雞蛋的甦醒、恢復活力、縮短升溫時間。
種蛋消毒。可以使用高錳酸鉀和福爾林按照一定比例燻蒸消毒30分鐘，或者使用消毒液均勻噴灑在蛋上。
溫度及溼度設置。孵化環境的溫度和溼度對於孵化成功至關重要，理論孵化溫度介於37.2到38.9度之間，相對溼度應保持在50%至65%，在實際使用過程中，孵蛋器溫度一般保持在37.8到38度之間。
翻蛋。入孵後需要定期翻蛋，每天需要翻蛋三到五次，有助於胚胎髮育，孵化至19天時，此時需適當提高室內溫度和溼度。
照蛋。入孵第四五天後可以對照蛋是否受精，明顯可以看到裏面有血絲或心跳就成功一半了。
晾蛋。在孵化的最後三天可以不用翻蛋，但要增加溼度並保持通風。
出殼。在孵化的最後階段，雛鳥會破殼而出。