孔姓的起源較為複雜，主要源於子姓、姬姓、媯姓，以及部分滿族和少數民族改姓。孔姓的起源和歷史流傳有多個版本，以下是詳細介紹：
商朝君主成湯的後代中，有一支以「子」和「乙」組合成姓氏，形成了孔姓。
西周初期，宋國司馬孔父嘉是成湯後裔，其後代逃到魯國並以「孔」為姓，孔子就是孔父嘉的後代。
春秋時期，衛國大夫姬孔悝和鄭穆公姬蘭的後代中，也有以「孔」為姓的。
春秋時期，陳國大夫媯孔寧和滿族中的一些部落，如孔尼喇氏、叩岱氏等，其後代中也有人以「孔」為姓。
宋朝時期，孔姓已經成為中國常見的姓氏之一，大約有21萬人，占全國人口的0.28%，位於第70位。
孔姓的分布也相當廣泛，從最初的山東曲阜逐漸擴散到河北、山西、湖南、廣東等地，並在唐宋時期進一步傳播到全國各地。
總的來說，孔姓的起源和發展是一個多源流、多層次的歷史過程，涉及多個民族和文化的融合。