處理密件時，應遵循以下方法：
物理銷燬。將密件切碎、撕碎或粉碎，使其無法恢復原狀。這可以通過手動方式或使用專業的文件碎紙機完成。
焚燒銷燬。在安全的環境下，使用高溫將密件完全燒燬。這種方法要求採取必要的防火措施，並確保符合環保要求。
化學處理。使用化學物質（如酸、鹼等）將密件溶解或腐蝕，使其無法恢復。同樣需要考慮到環保和安全問題。
數字銷燬。對於電子文件，使用數據擦除軟件或專業的數據銷燬工具徹底刪除並覆蓋文件內容，確保其無法被恢復。
磁介質銷燬。對存儲在磁介質（如磁帶、硬盤）上的密件，使用磁性破壞器或專業設備進行銷燬。
在處理過程中，應嚴格控制知悉範圍，避免密件被不應知悉者獲取或丟失。密件在使用後應及時退回機要保密室，且在辦公場所外區域禁止打印、複印、掃描密件。此外，密件的複印需嚴格履行審批手續，嚴禁擅自複印涉密文件資料。密件的保存也應嚴格管理，保存在符合保密要求的場所和部位，並定期清查、覈對。若出現密件丟失問題，應及時報告。在家中或公共網絡中嚴禁談論或傳輸任何涉密信息。處理密件時，應嚴格遵守相關法律法規，並諮詢公司或組織內部的保密部門或專業人員瞭解任何特定的銷燬要求。