寒夜三部曲的故事是關於三個不同的主角，他們各自在寒夜裡經歷不同的情感和生活困境。
首先是《寒夜》中的主人翁曾樹成，他是一個受到封建傳統教育影響較深的知識分子，有較好的學識，但卻不得不用它來為地主鄉紳服務。他受妻子和岳母的壓制，一再遷就她們，儘量滿足她們的願望，以此來求得家庭的和睦。然而，他的內心卻是痛苦的，他渴望自由，渴望人格的尊重。在家庭中得不到滿足的他，最終走向了毀滅。
其次是《寒夜》中的小林，他是一個接受過新思想的知識分子，他敢於反抗不合理的命運，不向命運低頭。然而，小林在追求自由和理想的過程中，也受到了很大的打擊和折磨。他感到自己像一隻被關在籠子裡的小鳥，無法自由飛翔。
最後是《寒夜》中的小蘭，她是一個天真純潔的少女，她對愛情充滿了美好的憧憬。然而，她的愛情卻並不順利，她經歷了許多挫折和磨難。最終，她選擇了離開這個世界，去尋找她認為真正的愛情。
另外兩部《病室中》和《拜金主義者求婚記》也是講述了人們在寒夜裡掙扎、追求生活和愛情的故事。
總的來說，寒夜三部曲的故事主題是關於人們在寒夜裡對自由、愛情、尊嚴和理想的追求和探索。