小分子蛋白，作為蛋白質的分解產物，通常以二肽、三肽或十肽以下的形式存在，具有多種對人體有益的作用。這些作用包括：
促進消化吸收。由於其較小的分子大小，這些肽類能夠被人體快速消化和吸收，從而更好地發揮蛋白質的底物作用。
促進細胞生長和機體修復。它們對於支持細胞生長、促進傷口癒合、維持組織健康等方面有重要作用。
促進新陳代謝和增強免疫力。這些小分子蛋白能激活休眠的細胞，清除自由基，改善細胞代謝，促進人體新陳代謝，從而增強人體健康。
促進骨骼生長和關節修復。對於風濕性關節炎、類風濕性關節炎等疾病有輔助治療效果。
美容養顏。小分子膠原蛋白能保持皮膚彈性和光澤，延緩衰老。
促進礦物質吸收和降低血壓。例如，酪蛋白磷酸肽可以促進鈣、鐵等礦物質的吸收，而降壓肽可以通過抑制血管緊張素轉換酶的活性來降低血壓。
這些小分子蛋白在臨床套用中，尤其對於住院病人、營養不良者或需要康復的人群，具有重要的輔助治療和健康促進作用。