峰林的形成是由自然內外力共同作用的結果，是地殼上升運動過程中，由於岩石軟硬程度不一致，軟的岩石被流水侵蝕搬運後，只有岩性較硬的岩石保留下來而最終形成的。以下是峰林形成的詳細過程：
沉積岩曾受到過擠壓力而形成褶皺，隨後地殼抬升使岩石出露地表，受到外力侵蝕作用，初期形成峰叢。
由於石灰岩易受流水溶蝕作用的影響，峰叢會被進一步溶蝕成為峰林。
地殼水平和垂直運動、岩石的風化、地表和地下水的溶蝕，以及沿節理裂隙的機械崩塌等都是形成峰林的因素。
充沛的降水和亞熱帶氣候為喀斯特作用提供能量和動力來源，地殼抬升導致河流下切，水循環加劇，形成峰林。