53,079元
年收入40萬的個人所得稅計算方式如下：
1.首先，確定適用的稅率和速算扣除數。根據提供的信息，年收入40萬意味著每月收入為33,333元。這個收入水平適用於25%的稅率，並且速算扣除數為2660元。
2.計算每月應納稅額。每月的應納稅所得額為33,333元減去5,000元的基本扣除，即28,333元。對於這個收入水平，適用的稅率為25%。
3.套用稅率和速算扣除數。每月的應納稅額為28,333元乘以25%，即7,083元。然後減去速算扣除數2,660元，得出每月實際應納稅額為4,423元。
4.計算全年應納稅總額。將每月的應納稅額乘以12個月，即4,423元乘以12個月，得出全年應納稅總額為53,079元。
綜上所述，年收入40萬需要繳納的個人所得稅大約為53,079元。