微生物製劑，通常稱爲微生態製劑或微生物調節劑，是一種活的微生物製劑，主要用於生態調控和動物營養保健。
這種製劑含有正常生理性菌或能促進這些菌生長的物質，用於補充或促生有益的生理性菌，以恢復和保持微生態平衡，從而達到防治疾病和增進健康的目的。微生態製劑通常是通過篩選自然界中的有益細菌，經過人工培養和生物工程工廠化生產而來，這些製劑可以改善動物腸道環境和水體環境，增強動物的免疫防禦能力，並抑制病原菌的生長。
此外，微生態製劑還包括益生菌、益生元和合生素等不同類型，這些製劑在醫療和動物保健領域具有廣泛應用。