關於德川家康的死因，最常見的說法是食物中毒，據說他吃了油炸鯛魚（天婦羅）後感到非常香甜可口，就多吃了一些，結果因爲自己突然攝入大量異體蛋白質，身體難以承受，然後就出現腸胃不適，肚脹如鼓，無法進食，日漸枯竭，醫館也未有迴天之術，於元和二年四月十七日便駕鶴西去了。然而，這種說法在日本史學界基本上不認可。
另外，有現代日本學者考據，德川家康的真正死因可能是胃癌。有關將軍府禁止天婦羅更多可能因爲其製作方法需要高油大火，府內爲了防火才做的規定。
此外，還有一些未經證實的傳聞或小說中提到德川家康在關原之戰被刺殺身亡，後世的德川家康其實是“影武者”世良田二郎三郎元信。但這種說法並沒有得到歷史學界的廣泛認可。
總的來說，德川家康的確切死因仍然是一箇謎，需要更多的歷史證據來證實。