拜文昌帝君的流程主要包括以下幾個步驟：
準備供品。包括香、燭、花、茶、水果、糕點等，以及一些特定的物品如文昌疏文、元寶、水果、紅紙、點心等，這些供品寓意着對文昌帝君的尊敬和祈求。
沐浴更衣。表示對文昌帝君的尊重。
燃香獻茶。在供桌前燃香、獻茶，表達對文昌帝君的敬意和祈求。
默唸文昌寶誥。默唸文昌寶誥，表達對文昌帝君的敬仰和祈求，並許下自己的願望，如希望學業進步、事業順利等。
三拜九叩。進行三拜九叩禮，表達對文昌帝君的尊敬和祈求。
焚燒文昌疏文和元寶。在香燒完三分之一時，焚燒文昌疏文和元寶，供奉給文昌帝君。
拜謝。完成祭拜後，再次三拜九叩，表示感謝。
撤供。拜謝後，可以撤掉供品。
此外，拜文昌帝君時還需注意選擇一箇適宜的時刻，如農曆二月初三，這是文昌帝君的誕辰，被認爲是祭拜的吉時。如果家附近沒有地方供奉文昌帝君，可以在家中祭拜，對準家中的文昌位進行祭拜。