《新還珠格格》的大結局中，主要角色的命運如下：
紫薇和爾康被封為明珠格格和駙馬，婚姻美滿幸福。
永琪和小燕子暫時分離，給家裡留下後代後，小燕子和晴兒、蕭劍、班傑明去大理，給蕭劍與晴兒舉行了婚禮，甜蜜幸福。班傑明默默守護著小燕子，小燕子與永琪在違背了兩年之約之後相見，開始了幸福甜蜜的生活，班傑明默默祝福著他們兩個，有些失落的策馬離去了。
柳青和金鎖成婚。
高明的弟弟高亮回京。
五阿哥為了和小燕子能夠了無牽掛地在一起，和原配妻子欣榮努力「造人」，生出了兒子綿憶後，自己則跑去找小燕子，最後兩人擁吻於花海之間。
以上是《新還珠格格》大結局的主要角色命運走向。