日本姓氏文化具有獨特的歷史背景和多樣性，反映了日本社會的多個方面。
日本姓氏的歷史並不長，直到4世紀中期大和政權成立後才開始出現姓氏。在公元670年，即天智9年，開始編制最初的戶籍《庚午年籍》，但此時的姓氏僅限於朝廷和貴族。直到1871年明治政府頒布《苗字必稱令》，規定「凡國民，必須起姓」，國民才開始為自己取名立姓。
日本姓氏的數量龐大，平均使用人數較少。1981年出版的《日本姓名詞典》收錄了七萬條日本使用人數較多的姓氏，而20世紀80年代時，所有在用的姓氏超過14萬個，是歷史的最高值。
日本姓氏的可變性極高，改姓較為頻繁。這是因為日本的家庭觀念以家業為中心，而不是血緣關係。在繼承制度下，沒有繼承權的子女需要自己開創家業並創造新的姓氏。此外，日本還存在開創新家業改姓的傳統，如一位「中山」姓氏的武將後代，棄武從商並發展壯大成為一方財閥後，改姓「鴻池」。
日本女性的姓氏在結婚後通常會變更為夫家姓氏，這是所謂的「夫婦同姓」要求。
日本人的姓氏中經常出現諸如川、田、山等字眼，這被認為與日本人嚮往自然有關，但也因為苗字必稱令的影響，當時文化不高的平民只能採用他們熟悉的名稱。
在日本，各地的姓氏分布不一樣，這與民族構成有一定的關係。例如，沖繩與那國比較多是因為古時那裡是琉球國的緣故，而北海道地方金田一併不少見，這是因為那裡是阿伊努族聚居的地方。
總的來說，日本姓氏文化是日本歷史、社會和文化的一個縮影，體現了日本人的家庭觀念、社會結構、自然嚮往和地域特色。