星星之所以會閃爍，主要是因爲光線在從星星傳播到地球的過程中，需要通過大氣層。
地球的大氣層由不同溫度、密度和壓力的氣體層組成，這些氣體層會隨着風向和溫差不斷變化。當星光穿過這樣的大氣層時，光線會被這些氣體層折射、散射和反射，導致光線的方向和強度發生變化。這種效應類似於水中的視線扭曲。因此，儘管星星本身並沒有變化，我們觀察到的星星卻因爲大氣層的擾動而出現了閃爍的效果。
此外，大氣中的湍流、氣流上升或下降等也會對光線產生擾動，使得星星看起來閃爍不定。這種現象在低空角度觀察時更爲顯著，因爲此時光線穿過較厚的大氣層，受到的干擾也相對較多。在高空觀察時，由於大氣層較薄，星星的閃爍現象相對減弱。