普查方式主要包括自查、檢查、抽查、全面清查、普查登記、數據報送等，其中自查、檢查、抽查是針對政府網站的方法；全面清查、普查登記、數據報送是針對經濟普查的方法。以下是針對不同對象的具體普查方法：
政府網站普查。自查，各政府網站主管單位根據普查指標自行檢查和整改所負責的網站；檢查，各組織單位對本地區或本部門網站進行檢查，確保覆蓋本級部門及其下屬單位的網站；抽查，國務院辦公廳根據各地各部門報送的政府網站信息，通過系統掃描和人工覆核方式進行抽查。
經濟普查。採取「地毯式」清查方法，對轄區內所有法人單位、產業活動單位和從事第二產業和第三產業活動的個體經營戶進行全面清查；在全面清查的基礎上，對法人單位和產業活動單位進行全面調查，同時對個體經營戶進行抽樣調查，以減輕調查負擔；數據採集和報送方式包括普查員使用電子設備採集數據、普查對象自主填報數據等。
此外，普查方式還有建立專門的普查機構進行直接登記、利用調查單位的原始記錄和核算資料進行調查等。