木瓜育苗方法主要包括以下幾種：
分株繁殖。木瓜的根系較淺，分櫱能力強，可以在植株周圍挖出二年生、高40至50厘米的幼株進行移栽定植。對於一年生較小的分櫱苗，挖出後移至苗圃，經過約1年的培育後即可出圃定植。
扦插育苗。在2至3月春芽未萌發前，剪取健壯的1至2年生枝條，截成15至20厘米長的小段進行斜插。扦插後需壓實土壤並澆水，覆蓋薄膜以提高溫度和保持濕潤。約4月初插條生根並開始萌芽後揭去薄膜，加強肥水管理。
種子育苗。秋播在10月下旬進行，春播在3至4月上旬進行。播種前應對種子進行處理，如用甲基托布津消毒，然後用小蘇打液浸種。播種後，應保持土壤濕潤並適當控制溫度。
壓條繁殖。對於植株中上部的枝條可採用空中壓條的方法，生根後切離母體單獨栽種。對於灌木狀叢生植株，可將下部的枝條下拉並固定在地面，然後埋土壓實，秋季落葉後切離母株栽種。
此外，育苗時還應選擇地勢較高、陽光充足、排灌水良好的地方。苗床管理方面，需控制適宜的溫度和濕度，及時澆水和施肥，並注意病蟲害的防治。