末位淘汰制是一種有爭議的管理策略，其主要弊端包括：
損害員工心理健康和工作滿意度。這種制度給員工帶來極大的心理壓力，導致焦慮、緊張和恐懼。員工可能會為了避免被淘汰而犧牲長期利益和客戶價值，甚至可能採取不正當競爭手段。
影響團隊精神和協作。末位淘汰制可能破壞團隊成員之間的信任和合作，導致員工之間出現競爭和敵意，特別是當涉及到緊密合作的任務時，這種內部競爭可能會對團隊的整體效率產生負面影響。
法律風險。在勞動契約期限內，以末位淘汰或競聘上崗等形式單方面解除勞動契約可能涉及違法風險。如果用人單位未能按照法律規定妥善處理，可能需要支付高額賠償金。
不公平且缺乏科學依據。末位淘汰制往往忽視了員工之間的個體差異、工作環境的不同因素以及考核標準的合理性。例如，在醫療或教育行業，這種一刀切的制度可能會對員工的心理健康和職業發展造成長遠傷害。
增加管理難度和成本。實施末位淘汰制可能需要大量的人力資源和財務資源，包括制定考核標準、執行考核過程、處理由此產生的勞動糾紛等，這些都會增加企業的管理難度和成本。
因此，雖然末位淘汰制在某些情況下可能短期內在提升績效方面取得一定效果，但長期來看，其對員工心理健康、團隊精神、法律風險和管理成本的負面影響是不可忽視的。