查理九世卡片原理是一種替換式加密方法，其原理可以概括為以下四個步驟：
選擇密鑰。密鑰是一個包含26個字母的字母表，每個字母只出現一次。這個字母表可以是隨機的，也可以是根據特定規則組成的。
明文加密。將明文中的每個字母根據密鑰進行替換。替換的規則是將明文字母替換為密鑰字母表中對應位置的字母。
密文解密。將密文中的每個字母根據密鑰進行逆替換，即將密文字母替換為密鑰字母表中對應位置的明文字母。
密鑰保密。密鑰是保證查理九世加密有效性的重要部分，因此密鑰的保密性對於加密的安全性至關重要。只有擁有正確密鑰的人才能夠正確解密密文。