核型分析是一種用於研究染色體數目和結構變異的重要方法，它主要用於細胞遺傳分類、物種間親緣關係研究，以及診斷染色體異常所引起的遺傳病。核型分析的方法主要包括：
常規形態分析。在顯微鏡下觀察有絲分裂中期染色體的形態特徵，如長度、著絲粒位置、臂比等，以確定染色體的類型和性別。
帶型分析。使用Giemsa染色技術或其他特殊染料使染色體呈現帶紋，通過這些帶紋的特異性來識別和區分不同的染色體。
著色區段分析。通過特定的化學處理使染色體出現異固縮反應，從而顯示異染色質區段的差異。
螢光原位雜交法。利用螢光標記的DNA探針對染色體中的特定DNA序列進行定位、定性和定量分析。
光譜核型分析法。這是一種顯微圖像處理技術，用於更精確地分析染色體。
計算機輔助技術。如染色體微陣列晶片，用於檢測染色體的細微變化，如結構異常、數目異常或易位缺失等。
核型分析的臨床意義在於診斷遺傳性疾病、研究物種間的親緣關係以及探討物種進化等方面。