植物真菌病害是由植物病原真菌引起的，約占植物病害的70～80%。這些病害可以影響一種作物上的幾種甚至幾十種真菌病害。真菌病害的症狀與病原真菌的分類有密切關係，例如白絹病菌在許多不同作物上均造成症狀相似的白絹病，霜黴菌產生霜霉狀物，黑粉菌產生黑粉狀物等。
真菌病害的侵染循環類型最多，許多病菌可形成特殊的組織或孢子越冬。在溫帶，土壤、帶病種子、病殘組織和果樹林木的病枝常是越冬場所；在熱帶和亞熱帶，不少病菌不越冬而越夏。冬季生長的寄主在侵染循環中往往起重要作用，有些病菌的分生孢子可越冬，有的病菌終年有危害性。
作物常見的真菌病害主要有白斑病、灰霉病、立枯病、根腐病、枯萎病等。發病原因主要有以下幾個方面：
作物生長環境：氣溫、土壤、地勢、播種時間、施肥方式和栽培方式等都會影響病害的發生。
不同作物對病害的敏感程度不同：有的作物對病害的抵抗力很強，有的作物抵抗力較弱。
外界環境條件：溫度、濕度等也會影響病害的發生。
防治植物真菌病害的方法主要包括選擇抗病品種、合理施肥、改善田間環境等。