樓蘭古城消失的原因是一箇歷史之謎，存在多種假說和解釋。以下是幾種主要的解釋：
自然災害說。這包括氣候變化導致的乾旱和洪水，以及河流改道或斷水。例如，有研究認爲樓蘭古城賴以生存的孔雀河上游發生滑坡，形成了堰塞湖，導致水源不足。另外，全球氣候變化也可能對樓蘭的命運產生了影響。
人爲因素說。這包括戰爭、疾病和生物入侵。例如，樓蘭古城可能因北方強國的入侵而遭受戰爭破壞。另外，樓蘭古城曾遭受過瘟疫和生物入侵，如螻蛄昆蟲的侵害，這些因素可能導致人口大量減少，迫使居民離開。
生態惡化說。這包括過度開採自然資源和砍伐樹木，以及羅布泊的南北遊移等。樓蘭古城的生態可能因過度開發而惡化，導致環境退化和資源枯竭。
社會內部矛盾說。這包括貴族與平民間的階層分化和階級矛盾加劇等。內部社會衝突可能導致樓蘭社會的不穩定，加速了其衰亡。
這些解釋並非相互排斥，而是可能共同作用於樓蘭古城的衰落和最終消失的過程。每種解釋都提供了對樓蘭古城消失原因的不同視角，反映了樓蘭歷史和環境的複雜性。