毛蛋的加工方法有多種，以下是幾種常見的加工方法：
煮製法。將毛蛋清洗乾淨，放入水中煮十五分鐘，然後撈出去皮。
炸製法。把去皮的毛蛋放入油鍋中炸至飄起，撈出控油。炸好的毛蛋可以撒上燒烤料、孜然、辣椒麵等調料食用。
發酵法。製作蛋坯，將蛋液注入模具後加熱製成蛋坯，然後切成小塊。將這些小塊蛋坯接種特定的發酵菌（如五通橋毛霉與藤黃微球菌的組合），在一定溫度下發酵。發酵完成後，將毛蛋放入烘箱中加熱，然後進行醃製。醃製液通常包含食鹽、姜粉、乙醇等成分。
燒烤法。將煮熟的毛蛋剝皮，穿在簽子上進行燒烤。燒烤時可以加入各種調料，如生抽、十三香、乾辣椒、花椒等。
滷製法。將毛蛋清洗乾淨，放入調好味的滷水中煮製。滷水中通常包含各種香料和調味料，如乾辣椒、大紅袍花椒、八角、桂皮等。
這些方法各有特色，可以根據個人口味和喜好選擇適合的加工方式。