毛豆腐的製作流程主要包括以下步驟：
準備豆腐和毛黴菌粉。首先清洗豆腐，然後晾乾，接著將豆腐切成均勻的塊狀。
準備毛黴菌粉。將毛黴菌粉倒入碗中，加入適量的純淨水溶解，製成毛黴菌液。
接種毛黴菌。將豆腐塊浸入毛黴菌液中，確保每塊豆腐都均勻裹上毛黴菌液。然後，將裹有毛黴菌的豆腐整齊地擺放在蒸鍋或竹蒸籠中，注意保持豆腐塊之間有一定的空隙以便毛黴菌生長。
發酵。在溫暖且濕潤的環境下進行發酵，時間大約為3到5天。如果溫度較低，可能需要適當保溫或延長發酵時間。發酵過程中，豆腐表面會長出白色絨毛。
調味和保存。發酵完成後，毛豆腐可以直接食用，也可以進一步調味和保存。例如，可以將其浸泡在白酒和香料煮製的水中，加入適量鹽，保存一段時間後即可食用。