水的溫度受多種因素影響，包括：
太陽輻射：太陽是地球上水體溫度的主要熱源。
長波有效輻射：這是太陽輻射中的一部分，對水體溫度有重要作用。
水面與大氣的熱量交換：水體通過蒸發、水面與空氣的接觸等方式與大氣進行熱量交換。
水面蒸發：水體蒸發時會帶走熱量，影響水溫。
水體的水力因素：包括水流速度、水深等因素，這些都會影響熱量分佈和水溫變化。
水體地質地貌特徵：不同的地質地貌特徵會影響熱量傳遞和水溫分佈。
補給水源：河流的補給水源類型和水量也會影響水溫。
地下水的溫度：地下水的溫度與地溫有密切關係，深層地下水溫度通常比較恆定。
河水的密度：靠近表層的河水與空氣溫度相近，而底層的河水溫度較低，因爲在這個溫度下水的密度最大。
水溫的變化還會影響水中細菌的生長繁殖和水的自然淨化作用。例如，水溫的突然增高可能是由於溫度較高的地面水大量流入的緣故，這可能表示地下水被污染。