水稻「三系」指的是在水稻育種中用於生產雜交種的三類水稻品種，分別是：
雄性不育系（A系）。這類水稻的雄蕊發育不正常，導致不能進行自花授粉結實，但雌蕊發育正常，可以接受其他水稻的花粉進行授粉。
雄性不育保持系（B系）。這種水稻的雄蕊發育正常，能夠產生正常數量的花粉，用於給不育系授粉，以保持不育系的雄性不育特性。
雄性不育恢復系（R系）。這種水稻的雄蕊發育正常，能夠產生正常數量的花粉，用於給不育系授粉，使得不育系恢復正常的可育性，能夠進行自花授粉結實。
這三種水稻的配合使用，使得水稻育種者能夠通過雜交獲得具有雜種優勢的雜交水稻品種，從而提高水稻的產量和抗逆性。