河南省的研究所包括：
河南省科學院下屬的多個研究所，如數學研究所、物理研究所、化學研究所、地理研究所、材料研究所、積體電路研究所、碳基複合材料研究院、高新技術研究中心、質量檢驗與分析測試研究中心、量子材料與物理研究所、雷射製造研究所、生物醫學研究所、智慧創製研究所、半導體研究所、新型顯示技術研究所、光資源與環境科學研究所、空天信息研究所、材料基因工程研究所等。
中電科22所（中國電子科技集團公司第二十二研究所），位於河南新鄉，是我國唯一從事電波環境特性研究的國家級專業研究所。
中電科27所（位於鄭州市鄭東新區），是中國電子科技集團公司下屬的早期外彈道測量系統工程研究所。
中船713所（位於鄭州市），是中國船舶集團下屬的國家重點研究所。
中船725所（洛陽船舶材料研究所），隸屬於中國船舶集團有限公司。
航空工業飛彈院(612所)（中國空空飛彈研究院），位於河南洛陽，是國家專業從事空空飛彈研製開發及批量生產的研究發展基地。
中鋼集團洛陽耐火材料研究院、鄭州機械研究所、中國空空飛彈研究院、中國航空研究院六一三研究所、鄭州機電工程研究所、洛陽船舶材料研究所、鄭州菸草研究院等，這些機構也位於河南省。
此外，河南省還有其他高等教育和研究機構，如鄭州大學、河南大學等雙一流大學，以及河南理工大學、鄭州輕工業大學等多所省屬高校。