河道污染的原因主要包括以下幾個方面：
工業廢水污染：工業生產過程中產生的廢水，如果不經過適當處理或處理不達標，直接排放到河流中，會導致河道生態系統受損，水質惡化。
農村生活垃圾污染：農村地區缺乏有效的垃圾處理系統，導致生活垃圾如菜葉、瓜果皮、塑膠袋、廢舊電池等直接進入河流，引起水質污染。
農業污染：化肥、農藥等農業投入品通過農田排水和地表徑流進入水體，導致水體富營養化，影響水質。
畜牧養殖業污染：畜牧養殖業產生的廢水直接排放到河道中，或者中小型養殖場缺乏配套處理設施，導致廢水未經處理即排入河流。
外源性污染輸入：河道補水水源本底值較高，或者河道的補水以污水處理廠的退水或尾水為主，導致河道污染。
點源污染未得到有效控制：排污口未得到妥善管理，是河道污染的主要原因之一。
面源污染廣泛：城市、城郊和農村的面源污染以直排或雨污混合的形式進入河道，成為主要污染源。
水繫結構不合理：河道水繫結構複雜，存在斷頭河道、淤塞河段等問題，導致污染難以控制。
河道功能被異化：城區地下排水管網老化，雨污混接，導致河道成為納污通道。
水生態系統崩潰：水體納污能力下降，水環境服務功能喪失。
雨水污染：初期雨水對河道水質的影響也不容忽視，尤其是經過城市地表的雨水，可能攜帶大量污染物。