流域治理方法主要包括以下幾個方面：
制定法律法規。建立完善的流域法律法規體系，確保流域管理與市場經濟相適應，強化依法治水，提高流域管理的權威性。
建立綜合管理機制。理順流域管理和區域管理的關係，綜合運用經濟、法律和行政手段，有效協調流域管理與區域管理的矛盾。
轉變水污染防治思路。根據不同流域水體功能和水資源承載能力，實行取水、入河排污許可制度和總量控制，建立相應的考核制度。
推行清潔生產。建立節水型社會，加強污水處理系統建設，提高污水處理能力，減少工業、農業、交通、城市生活等產生的污染物直排。
加強水質監測與源頭控制。強化水質監測，尤其是跨界斷面水質監測，同時提高河流自淨能力。
小流域治理。以小流域為單元進行全面規劃，安排農林牧副各業用地，布置各種水土保持措施。
公眾參與和環保宣傳。加大環保宣傳力度，提高公眾對水資源、水土流失和生態破壞的認識，樹立公民對水環境保護的責任感。
加強科研與技術發展。以基礎科研作為支撐，加強突發性水污染事件應急管理技術等的研究。
水資源統一調度與管理。構建目標科學、配置合理、調度最佳化、監管有力的水資源調度管理體系，保障流域供水安全和河道基本生態流量。
實施財政和政策支持。通過財政轉移支付和政策支持，加大對流域治理的投入，推動流域治理工作的實施。
通過上述綜合措施的實施，可以有效保護水土資源，防止水土流失，提高水資源利用效率，確保流域的可持續發展。