海葡萄的修剪主要包括冬季修剪和夏季修剪兩種。
冬季修剪通常在休眠期進行，採用短截、疏剪、回縮等方法整形，目的是去除病蟲害枝、機械損傷枝、無結果能力的弱枝、未成熟枝條和過密枝，調節植株負載量，培養預備枝，及時更新衰老枝蔓，控制結果部位上移。夏季修剪包括抹芽、摘心、定梢、摘除卷鬚和老葉、環狀剝皮、新梢綁縛等操作，目的是控制新梢徒長、調整養分分配、改善光照條件，提高果實的產量和品質。
修剪工作應在落葉後樹體養分充分回流之後至翌年樹液開始流動前完成，例如山東地區一般在12月至2月中旬前完成。修剪方法的選擇取決於生產管理水平、栽培方式和栽培目的等因素。例如，當年生枝條修剪後只保留1個芽，極短梢修剪適用於結果性狀良好、花芽分化好的品種及架式。冬季修剪時，對成熟的一年生枝留1~3節的修剪方法可以防止結果部位外移而遠離主枝或側枝。