海關查驗通常包括機檢、人工檢和機檢轉人工檢三種方式：
機檢：使用技術檢查設備，如X光機，對貨物進行透視掃描，分析貨物的實際狀況是否與申報內容相符。這種方式適用於集裝箱裝載的大宗單一商品、不宜直接開拆的商品、有夾藏嫌疑的商品和危險品等貨物。如果貨物屬於這些範圍，貨主可以向海關提出機檢查驗的要求。
人工檢：由海關工作人員攜帶武警，與報關行或貨主一同前往指定場所查驗貨物。人工查驗包括外形查驗、開箱查驗和徹底查驗三種方式：
外形查驗：對外部特徵直觀、易於判斷基本屬性的貨物的包裝、運輸標誌和外觀等狀況進行驗覈。
開箱查驗：將貨物從集裝箱、貨櫃車箱等箱體中取出並拆除外包裝後對貨物實際狀況進行驗覈。
徹底查驗：對貨物逐件開箱（包）查驗，詳細驗覈貨物的品種、規格、數量、重量、原產地等方面的狀況是否與申報相符，適用於有走私違規嫌疑的貨物。
機檢轉人工檢：在機檢過程中，如果存在無法看清貨物的情況，需要進一步開箱進行人工查驗覈實。
海關選擇查驗的方式是根據貨物的具體情況、人工或系統做出的查驗指令以及相關的政策要求等共同做出的決定。查驗操作可以分爲人工查驗和設備查驗，海關可以根據貨物情況以及實際執法需要，確定具體的查驗方式。