淡菜的保存方法取決於其狀態，即是否為新鮮或乾燥的淡菜。
對於新鮮淡菜，可以採取以下保存方法：
將新鮮淡菜放在用海鹽調配的淡鹽水中，確保水沒過淡菜表面，然後將其放置在陰涼通風的地方，注意溫度要低，以避免高溫導致淡菜死亡。在天氣較熱時，可以向水中添加冰塊或直接將淡菜放入冷櫃中保存。
可以將新鮮淡菜清洗乾淨後，放在乾燥陰涼的地方或密封的玻璃罐中。
對於乾燥淡菜，可以採取以下保存方法：
將乾燥的淡菜密封保存，並放在乾燥通風的地方。為了進一步延長保存時間，可以將乾燥淡菜密封後放入冰櫃的冷藏室冷凍保存，這樣處理過的淡菜存放時間可長達12個月以上。
也可以將乾燥淡菜放在密封的玻璃罐中，並每隔一段時間拿出來曬一下太陽，晾涼後再放回玻璃罐中。
無論哪種保存方法，在食用前都需要徹底清洗淡菜，以確保去除其中可能存在的泥沙。